Эта отрасль в области пока представлена одним крупным предприятием - ОАО "Апатит". Многолетняя работа этого уникального предприятия оказала серьезное влияние на весь природный комплекс Хибин, что прослеживается по трем главным направлениям: нарушение ландшафта в результате крупномасштабных горных разработок, загрязнение воздуха пылью с обширных хвостохранилищ, а также загрязнение близлежащих водоемов промышленными стоками.
В 1999 году сброс сточных вод от ОАО "Апатит" по сравнению с предыдущим годом увеличился на 2,7 млн. м3 за счет увеличения притока шахтно- рудничных вод и составил 164,4 млн.м3.
В связи с этим увеличился и сброс загрязняющих веществ, поступающих в водные объекты со сточными водами: сульфатов на 346,7 т, органических веществ (по БПК полн.) на 49,7 т, фтора на 42,1 т.
Вместе с тем отмечается уменьшения сбросов в водные объекты взвешенных веществ на 412,7 т, хлоридов на 91,6 т, фосфатов на 12,8 т, азота нитратного на 70,7 т.